Chez Les Chasseurs-Cueilleurs Hadza Les Bactéries Intestinales Varient Selon Les Saisons

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La découverte, dans le cadre d’une étude sur les chasseurs-cueilleurs en Afrique, pourrait éventuellement aider les scientifiques à comprendre comment les régimes alimentaires modernes ont affecté la santé.

En Tanzanie, non loin du Serengeti, vivent les Hadza, une communauté d’environ 1 300 personnes. Ce petit groupe attire beaucoup l’attention des scientifiques.

Beaucoup de Hadza vivent uniquement des animaux qu’ils tuent, du miel, des baies et de quelques autres aliments sauvages. Pour les premiers 95 % de l’histoire de notre espèce, il n’ y avait pas d’autre façon de vivre.

Ainsi, les Hadza ont été scrutés de près à la recherche d’indices sur le mode de vie des chasseurs-cueilleurs: la façon de trouver leur nourriture, la quantité d’énergie qu’ils consomment, et même la quantité de sommeil qu’ils s’octroient.

Jeudi, les scientifiques ont décrit une autre manière dont les Hadza sont exceptionnels. Leur microbiome intestinal – les bactéries qui vivent dans leur intestin – évolue selon un cycle annuel prévisible.

Certaines espèces bactériennes disparaissent complètement puis reviennent, à un rythme qui reflète probablement des changements réguliers dans l’alimentation des Hadza. De nombreuses bactéries intestinales qui s’estompent radicalement sont rares chez les personnes vivant dans les sociétés industrialisées.

“Nous ne savons pas vraiment de quoi sont capables ces microbes saisonniers “, explique Justin Sonnenburg, microbiologiste à l’Université de Stanford et auteur principal de la nouvelle étude.

Chacun d’entre nous transporte environ 30 milliards de bactéries, appartenant à des milliers d’espèces. M. Sonnenburg espère qu’en comparant les microbiomes des chasseurs-cueilleurs avec ceux des gens de différentes sociétés, les scientifiques seront en mesure d’apprendre comment les régimes alimentaires influencent leur composition.

À mesure que de plus en plus de sociétés adoptent un régime alimentaire occidental, leurs microbiomes peuvent changer, altérant leur santé. Nous devons nous considérer comme ces organismes composites, composés de parties microbiennes et humaines “, a déclaré le Dr Sonnenburg.

Jusqu’ à récemment, les microbiologistes ont principalement étudié les microbiomes des personnes qui consommaient un régime alimentaire occidental. Maintenant, ils ont décidés de viser plus large.

En 2013, Stephanie Schnorr, alors étudiante de troisième cycle d’anthropologie évolutionnaire à à l’Institut Max Planck de Leipzig (Allemagne), entreprend la première étude du microbiome des Hadza.

Lors d’une rencontre avec des dirigeants communautaires, elle et ses collègues ont expliqué leur plan: recueillir des échantillons de selles et étudier les microbes dans un laboratoire.

“L’un des anciens du camp a dit: “Eh bien, nous le donnons à la terre, alors pourquoi ne pas le lui donner à elle ?” a raconté le Dr Schnorr, maintenant chercheur postdoctoral à l’Université de l’Oklahoma.

Le Dr Schnorr a fini par extraire l’ADN des microbes de l’intérieur de 27 Hadza et les a comparés à des échantillons prélevés chez des personnes de Bologne, en Italie. En 2014, elle et ses collègues ont signalé des différences frappantes.

Les chercheurs ont découvert que les Hadza abritaient une plus grande diversité d’espèces microbiennes intestinales que les Italiens, et qu’il y avait des différences fondamentales dans les espèces qu’ils transportaient. Certains qui étaient communs dans les Hadza étaient rares ou manquants chez les Italiens.

L’étude a soulevé de nombreuses questions sur les facteurs qui déterminent quelles espèces vivent dans un groupe particulier de personnes.

En 2013, Jeff Leach, chercheur invité au King’s College de Londres, a commencé à travailler avec le National Institute for Medical Research de Tanzanie pour prélever quatre fois par an des échantillons de selles des Hadza.

Certains échantillons ont été prélevés pendant la saison sèche en Tanzanie, d’autres pendant la saison des pluies. Le Dr Sonnenburg a supervisé l’analyse des échantillons de 188 Hadza. Dans la nouvelle étude, publiée dans la revue Science, lui et ses collègues ont fait état de fortes fluctuations dans la composition des bactéries intestinales.

Certaines espèces étaient plus fréquentes au cours d’une saison que d’une autre; certaines disparaissaient tout simplement complètement. Une comparaison de ces échantillons avec ceux prélevés par le Dr Schnorr a confirmé que les fluctuations se produisaient dans un cycle régulier.

“En ce qui concerne la structure du microbiome des Hadza, nous pouvons dire que nous avons une assez bonne compréhension à ce sujet “, a déclaré le Dr Schnorr. “Mais la découverte d’un cycle saisonnier est nouvelle, pour tout microbiome humain.”

Les chercheurs savaient déjà que la composition des bactéries intestinales pouvait changer rapidement. Un changement brusque de régime alimentaire entraînera un changement soudain du microbiome intestinal, en un ou deux jours.” d’après le Dr. Sonnenberg.

Mais personne n’avait jamais documenté un cycle à long terme prévisible des espèces intestinales chez un groupe de personnes en bonne santé qui s’adonnent à leurs activités quotidiennes.

Le Dr Sonnenburg a supposé que le régime alimentaire des Hadza dictait la composition de ces communautés bactériennes. Tout au long de l’année, les Hadza cueillent les fruits des baobabs.

Mais pendant la saison sèche, ils creusent aussi pour trouver des tubercules et mangent beaucoup de viande, car il est plus facile de chasser les animaux dans un paysage aride. Pendant la saison des pluies, ils se nourrissent de baies et récoltent le miel des ruches.

Dans la nouvelle étude, le Dr Sonnenburg et ses collègues ont également comparé le microbiome des Hadza avec celui de personnes appartenant à 17 autres sociétés, y compris des citadins américains et des villageois de Yanomamo dans la forêt amazonienne.

Le microbiome de Hadza est le plus proche de celui des sociétés traditionnelles et le moins industrialisé. Les chercheurs ont découvert que les espèces qui distinguent le plus les Hadza des sociétés industrielles sont aussi celles qui sont les plus saisonnières.

Les familles d’espèces bactériennes qui oscillent le plus fortement sur un an dans l’intestin des Hadza sont extrêmement rares dans les pays développés. Les chercheurs ne savent pas pourquoi.

“C’est une énorme question – c’est l’éléphant dans la pièce”, a déclaré le Dr Schnorr.

Les Hadza peuvent donner des indices sur ce qu’était le microbiome dans d’autres sociétés avant que les régimes alimentaires ne soient transformés par l’agriculture et l’industrie modernes. Le sucre raffiné et d’autres nouveaux aliments, par exemple, peuvent avoir favorisé un nouvel ensemble de microbes intestinaux par rapport à ceux qui se nourrissent de fibres végétales dures.

Et une fois que les gens ont commencé à manger les mêmes aliments toute l’année, une perte de saisonnalité peut avoir entraîné la disparition de certaines espèces bactériennes ancestrales.

“Nous sommes dans un état bizarre et perturbé où bon nombre des microbes avec lesquels nous avons co-évolués ne sont pas équipés pour prospérer”, a affirmé le Dr Sonnenburg.

En comparant les microbiomes du monde entier, le Dr Sonnenburg pense qu’il serait possible de comprendre comment les microbes intestinaux liés à l’industrialisation affectent la santé des gens. Il a émis l’hypothèse, par exemple, qu’ils peuvent causer des inflammations chroniques.

Dans leur nouvelle étude, les chercheurs ont découvert que les microbes dans les tripes des Américains fabriquent plus d’enzymes qui dégradent les mucines que ceux des Hadza. Ces enzymes permettent aux bactéries de récolter les glucides de la muqueuse intestinale plutôt que des fibres végétales.

Le résultat ? “Si vous ne nourrissez pas votre intestin avec des fibres alimentaires,” dit le Dr Sonnenburg,”votre intestin se nourrit de vous.”

SOURCE

Traduction EXTACIDE

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